Studijní oddělení zajišťuje všechny organizační, dokumentační, právní a administrativní záležitosti týkající se studentů a jejich studia. Kromě toho zajišťuje agendu přijímacího řízení, imatrikulací prvních ročníků či promocí. Metodicky je řízeno proděkanem pro studijní záležitosti.
Vedle zabezpečení aktuální studijní agendy  spravuje  archiv studijního oddělení, vydává výpisy o studiu či duplikáty dokladů a dokumentů, jejichž kopie jsou uloženy ve studentských složkách. Některé z těchto nadstandardních administrativních úkonů jsou zpoplatněny podle výnosu rektora AMU.

Poplatek za úkony spojené s posuzováním žádosti o uznání vysokoškolského vzdělání v zahraničí činí 3000 Kč /Výnos rektora č. 8/2016 s pokyny k platbě/. Doklad o úhradě je nutné přiložit k žádosti. Další povinné přílohy jsou uvedeny na formuláři žádosti. Před podáním žádosti a zaplacením poplatku doporučujeme žadatelům ověřit si, které studijní obory jsou na HAMU akreditovány. Studium jiných akreditovaných oborů není možné uznat! 

Vyřizování žádostí absolventů HAMU o vydávání osvědčení užívat akademický titul MgA., který se uděluje od roku 1998 (bez poplatku).